酵母についてwikiより引用


酵母
”S.cerevisiae” : 右上は出芽中
生物の分類 分類
ドメイン: 真核生物 :en:Eukaryote Eukaryota
界: 菌類 菌界 :en:Fungus Fungi
子嚢菌門
サッカロマイセス属 ”Saccharomyces”
カンジダ属 ”Candida”
トルロプシス属 ”Torulopsis”
ジゴサッカロマイセス属 ”Zygosaccharomyces”
”シゾサッカロマイセス”属 ”Schizosaccharomyces”
”ピチア”属 ”Pichia”
ヤロウィア属 ”Yarrowia”
ハンセヌラ属 ”Hansenula”
クルイウェロマイセス属 ”Kluyveromyces”
デバリオマイセス属 ”Debaryomyces”
ゲオトリクム属 ”Geotrichum”
ウィッケルハミア属 ”Wickerhamia”
フェロマイセス属 ”Fellomyces”

酵母菌
『酵母』より : ”S.cerevisiae” : 右上は出芽中
生物の分類 分類
ドメイン: 真核生物 :en:Eukaryote Eukaryota
界: 菌類 菌界 :en:Fungus Fungi
サッカロマイセス Saccharomyces属
カンジダ Candida属
Torulopsis属
Zygosaccharomyces属
シゾサッカロマイセス Shizosaccharomyces属
ピチア Pichia属
Yarrowia属
Hansenula属
Kluyveromyces属
Debaryomyces属
Geotrichum属

酵母2ハイブリット法
『Two-hybrid 法』より : Two-hybrid 法とは蛋白質間相互作用を調べる手法の一つ。出芽酵母 Saccharomyces cerevisiae を用いた yeast two-hybrid (Y2H) system が最初に構築された (Fields and Song, 1989)。生物種を酵母から大腸菌にかえたり、GAL4 の代わりに LexA を用いる、Ras シグナル経路を用いる、など様々な改変型手法がある。
原法では転写 (生物学) 転写活性化因子である GAL4 蛋白質の DNA 結合ドメインとアクティベータドメインが分離可能であることを利用している。GAL4 の DNA 結合ドメイン (DBD) は UASG (Upstream Activatin Sequences for galactose) と呼ばれる塩基配列に結合するという機能を持つ。一方、酸性アミノ酸に富んだカルボキシル末端ドメインは転写因子の会合を促進し、転写を促進する機能を持つ。ここで、GAL4DBD と任意の蛋白質 A を融合蛋白質として発現させ、同時に同じ細胞内でアクティベータドメイン (TA) と蛋白質 B を融合蛋白質として発現させる。蛋白質 A と蛋白質 B が相互作用しないなら DNA 結合ドメインと転写活性化ドメインは近接せず、蛋白質 A と蛋白質 B が相互作用をするなら、GAL4 DNA 結合ドメインとアクティベータドメインが近接することになる。後者のとき、UASG を上流にもつレポーター遺伝子が酵母細胞に導入されていれば、その発現量が上昇し、これによって蛋白質Aと蛋白質Bの相互作用の有無あるいは強度を検定できる。このようにして二種の蛋白質間の相互作用や、さらには相互作用に関わるドメインの推測、また重要なアミノ酸の検討などを行うことができる。魚釣りに見立てて GAL4DBD-融合タンパク質を bait（釣り餌）、TA-融合タンパク質を prey（餌食）と呼ぶ。







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